Ο Μπακάκης έκανε γνωστή την απόφασή του με μια συγκινητική ανάρτηση στα social media, στην οποία ανέφερε πως το ποδόσφαιρο ήταν για εκείνον περισσότερο από επάγγελμα — ήταν τρόπος ζωής και ευχαρίστησε όσους τον στήριξαν όλα αυτά τα χρόνια.
Σε όλη τη διάρκεια της καριέρας του φόρεσε κυρίως τις φανέλες της ΑΕΚ και του Παναιτωλικού, είχε και συμμετοχές με την Εθνική Ελλάδας, και πανηγύρισε σημαντικούς τίτλους όπως το Κύπελλο Ελλάδας (2016) και το Πρωτάθλημα (2018) με την ΑΕΚ.
Η ΑΕΚ, έγραψε στα social media: «Μιχάλη, θα είσαι πάντα ένας από εμάς» ανεβάζοντας την παρακάτω φωτογραφία:
